Laut einem Bericht der Zeitung „Die Welt“ nutzte der Minister für dienstliche Vorgänge auch einen privaten Mail-Account. Dabei beruft sich das Blatt auf eine Notiz vom Dezember 2018 eines damaligen Staatssekretärs des CSU-Politikers. Ein Sprecher Scheuers erklärte, ihm lägen zu dem Vorwurf keinerlei Informationen vor.
Ein parlamentarischer Untersuchungsausschuss arbeitet derzeit die Vorgänge rund um die gescheiterte Pkw-Maut auf. Scheuer hatte Verträge zur Erhebung der Maut geschlossen, noch bevor endgültige Rechtssicherheit über das Projekt bestand.